第三季故事以吾郎在海堂高中棒球部二军和二军的队友们同心协力在饯行赛中打败海堂一军，吾郎自动退学为始，展开了吾郎追寻梦想追求挑战的新的棒球生活。吾郎转读仅有8个男生的圣秀高中。在他的努力下，终于亲手建立了圣秀高中有史以来的第一个棒球部，队员中有清水的弟弟清水大河，有曾经吊儿郎当但受到吾郎投球感动的藤井，也有因为父亲的阻挠而几乎放弃棒球却被吾郎唤起斗志的田代，还有完全没有打过棒球运动神经超差但是因为吾郎的真诚而决定助吾郎一臂之力的各位菜鸟，吾郎与这些队友们一起练习，一起为棒球流血流汗，终于在高三迎来了高中棒球夏季联赛。为了打败海堂，吾郎他们面临众多强有力的挑战者，有好朋友小森、山根所在的三船高中代表队，有超强组合香取、唐泽所在的久里山高中代表，吾郎他们能够打败这些强队，从而获得挑战好朋友佐藤寿也所在的海堂一军的机会吗